Menurut wartawan Barry Miles, selepas Lennon dan Ono telah cedera dalam kemalangan kereta pada bulan Jun 1969, separuh jalan rakaman Abbey Road, katil yang dipasang di studio dengan mikrofon supaya kedua boleh membuat komen seni mengenai album. Miles fikir kehadiran berterusan Ono di studio pada penghujung kerjaya Beatles meletakkan tekanan pada hubungan Lennon dengan ahli-ahli kumpulan yang lain. George Harrison secara lisan menyerang beliau selepas beliau mengambil salah satu biskut penghadaman coklat tanpa meminta. Akhbar Inggeris menggelarkannya "wanita yang membubarkan the Beatles", tetapi Ono telah menyatakan bahawa Beatles berpecah diri mereka sendiri tanpa sebarang penglibatan langsung dari beliau, sambil menambah "Saya tidak fikir saya boleh cuba juga untuk membubarkan mereka." Dalam temu bual dengan Dick Cavett, Lennon jelas menafikan Ono membubarkan The Beatles dan juga Harrison berkata dalam satu temu bual dengan Cavett bahawa The Beatles mempunyai masalah lama sebelum Ono datang.

Walaupun Beatles telah bersama-sama, setiap lagu yang ditulis oleh Lennon atau McCartney telah dikreditkan sebagai Lennon-McCartney tidak kira sama ada lagu itu kerjasama atau ditulis semata-mata oleh salah satu daripada dua (kecuali yang terdapat dalam album pertama mereka, Please Please Me, yang asalnya dikreditkan lagu untuk McCartney-Lennon). Pada tahun 1976, McCartney mengeluarkan satu album live bertajuk, Wings over America, yang mengkreditkan lima Beatles menjejaki sebagai komposisi P. McCartney-J. Lennon, tetapi bukan Lennon atau Ono membantah. Selepas kematian Lennon, bagaimanapun, McCartney sekali lagi cuba untuk mengubah perintah itu untuk McCartney-Lennon untuk lagu-lagu yang semata-mata atau terutamanya yang ditulis oleh beliau, seperti "Yesterday," tetapi Ono tidak akan membenarkannya, berkata dia merasakan ini memecahkan perjanjian bahawa dua telah dibuat semasa Lennon masih hidup, dan yang masih hidup Beatle berhujah bahawa perjanjian itu tidak pernah wujud. Jurucakap Ono berkata McCartney telah membuat "satu percubaan untuk menulis semula sejarah".

Dalam temu bual Rolling Stones pada tahun 1987, Ono berkata tempat McCartney dalam proses perpecahan band. Dalam antologi John Lennon 1998, Lennon Legend, kredit komposer daripada "Give Peace a Chance" telah ditukar kepada "John Lennon" daripada kredit mengarang asalnya iaitu "Lennon-McCartney." Walaupun lagu itu ditulis oleh Lennon sepanjang tempoh perkhidmatan beliau dengan Beatles, ia telah menulis dan dirakam tanpa bantuan band, dan dikeluarkan sebagai single pertama bebas Lennon di bawah jolokan "Plastik Ono Band". Lennon melahirkan rasa kesal bahawa dia tidak diberi kredit bersama bertulis kepada Ono sebaliknya, yang sebenarnya membantu beliau menulis lagu. Pada tahun 2002, McCartney mengeluarkan satu lagi album live, Back in the U.S. Live 2002, dan 19 lagu-lagu The Beatles termasuk digambarkan sebagai "digubah oleh Paul McCartney dan John Lennon", yang mencetuskan perdebatan mengenai kredit dengan Ono. Jurucakap beliau Elliott Mintz menyebutnya "usaha untuk menulis semula sejarah.", namun, Ono tidak mendakwa.

Pada tahun 1995, selepas Beatles mengeluarkan Lennon "Free as a Bird" dan "Real Love", dengan demo disediakan oleh Ono, McCartney dan keluarganya bekerjasama dengan beliau dan Sean untuk mencipta lagu "Hiroshima Sky is Always Blue", yang memperingati ulang tahun ke-50 pengeboman atom bandar Jepun. Ono, McCartney menyatakan: ". Saya fikir dia adalah seorang wanita yang saya fikir itu salah ..... dia sebaliknya ..... Saya fikir dia hanya lebih ditentukan daripada kebanyakan orang untuk menjadi dirinya sendiri." Dua tahun kemudian, bagaimanapun, Ono secara umumnya membandingkan Lennon untuk Wolfgang Amadeus Mozart, manakala McCartney, katanya, hampir menyerupai saingan Antonio Salieri yang kurang berbakat. Kata-kata ini menaikkan kemarahan isteri McCartney, Linda, yang telah mati akibat kanser payudara pada masa itu, dan apabila Linda meninggal dunia kurang daripada setahun kemudian, McCartney tidak menjemput Ono untuk upacara isterinya di Manhattan.

Menerima Anugerah Q pada tahun 2005 Ono menyebut bahawa Lennon pernah berasa tidak selamat tentang penulisan lagu beliau. Dia menjawab, "Anda seorang penulis lagu yang baik. Ia bukan Jun dengan sudu yang anda tulis. Anda seorang penyanyi yang baik, dan pemuzik mungkin sedikit gementar meliputi lagu-lagu anda."

Dalam temuramah Oktober 2010, Ono bercakap mengenai "hujung minggu hilang" Lennon dan perdamaian berikut beliau dengannya. Beliau mengkreditkan McCartney dengan membantu menyelamatkan perkahwinannya dengan John. "Saya mahu dunia tahu bahawa ia adalah satu perkara yang sangat menyentuh yang Paul lakukan untuk John." Semasa melawat dengan Ono pada Mac 1974, McCartney, semasa meninggalkan, bertanya "Apa yang akan membuat anda kembali kepada John?" McCartney kemudiannya meluluskan maklumbalasnya kepada Lennon semasa melawat beliau di Los Angeles. "John sering berkata beliau tidak faham mengapa Paul melakukan ini untuk kami, tetapi dia lakukan." Pada tahun 2012, McCartney mendedahkan bahawa beliau tidak menyalahkan Ono untuk perpecahan The Beatles dan mengkreditkan Ono dengan banyak inspirasi kerja Lennon selepas Beatles.

Perhubungan dengan Julian Lennon

Ono mempunyai hubungan yang sukar dengan anak tirinya, Julian anak Lennon, yang telah meningkat sejak beberapa tahun. Beliau telah melahirkan rasa kecewa dengan pengendaliannya terhadap harta Lennon, dan perbezaan antara pendidikan Sean dan beliau, sambil menambah, "apabila Ayah berhenti mendengar muzik selama beberapa tahun untuk bersama dengan Sean, mengapa tidak boleh dia berbuat demikian dengan saya?"[91] Lebih benar-benar, bagaimanapun, Julian diketepikan daripada kehendak bapanya, dan beliau bertarung dengan Ono di mahkamah selama bertahun-tahun, menetap pada 1996 untuk jumlah yang tidak ditentukan yang kertas dilaporkan telah "dipercayai" berada dalam bidang £ 20 juta, yang Julian menafikan.[18]

Beliau mengakui bahawa dia adalah "anak ibu", yang Ono telah dinamakan sebagai sebab mengapa dia tidak pernah mampu untuk mendapatkan dekat dengan beliau. "Julian dan saya cuba untuk berkawan. Sudah tentu, jika dia terlalu mesra dengan saya, maka Saya berfikir bahawa ia menyakitkan saudara-mara yang lain. Beliau sangat setia kepada ibunya. itu adalah perkara yang pertama, yang telah di dalam fikirannya." Walau bagaimanapun, beliau dan Sean menghadiri pembukaan pameran foto Julian di Morrison Hotel di New York City pada tahun 2010,[92] muncul buat kali pertama untuk gambar dengan Cynthia dan Julian. Beliau juga mempromosikan pameran itu di laman web beliau, dan Julian dan Sean menjadi rapat.[93]